草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人入侵他的大脑，使其自残。

近未来，为了治疗现代人类越来越多、越来越严重的精神疾病，位于东京的精神医疗综合研究所开发出一种可以反映他人梦境的机器。通过微型DC的帮助，梦境在显示器上呈现出来，更方便找到一个人焦虑的症结。

在并不遥远的未来，愚蠢的人类发动大规模战争，将赖以生存的世界变成废墟。昔日的国际大都会纽约，破破烂烂的街上走来了杜南·纳兹（Luci Christian 配音）及其半机械人男友布里艾诺斯（David Matranga 配音），他们刚刚搞砸贪婪大佬双角（Wendel Calvert 配音），无奈只得再度延后前往奥林帕斯的日期。双角承诺交给二人最后一次任务，谁知杜南他们却意外救下了被鸵鸟人战斗机器追杀的艾瑞丝（Brina Palencia 配音） 和 奥尔森（Adam Gibbs 配音）。后者来自奥林帕斯，此行他们肩负了关系全人类命运的绝密使命。谁知战争狂人塔洛斯（Josh Sheltz 配音）带着手下精兵悍将尾随而至，企图掌握艾瑞丝她们的秘密。杜南、布里乃至双角都被卷入这场难以预料的战斗中去……