童年的头球练习中，天赋异禀的少年野球十兵卫（坂口拓 饰）误杀了他的爸爸（ミッキー・カーチス 饰）。在此之后，发誓绝不再打球的十兵卫自甘沉沦，在17岁的大好年华之际成为了全国通缉的超级少年犯。最终他被警方逮捕，投入了充斥着诸多恶行少年的少管所——鸟龙矫正学院。冷酷变态的女院长三船统治着这里，给少年们最差的待遇和最难以下咽的饭菜。她花言巧语骗取了十兵卫的信任，后者同意带领进之助（星野真里 饰）等少年犯们参加暴力血腥的“全国非行甲子园”。他们首轮的对手是有一群杀人如麻、冷血残忍的女子组成的黑色大丽花队，而所谓的球场，俨然一处毫无希望的屠杀之地……

以天竺为目标的僧人玄奘（仓科加奈 饰）正行走在漫长而艰辛的旅途之上。这一天，老爷爷（山田凉成 饰）和老婆婆（笹野高史 饰）找到玄奘，希望他能封住不良少年山田太郎（松山研一 饰）的妖力。凭借宝珠的力量，太郎的妖力遭到封印，而他也被迫跟随玄奘踏上洗心革面的征途。这个时常全裸且肆无忌惮放着臭屁的问题少年，将给这段征程增添怎样的色彩呢？

TVドラマやコミックなどのメディアミックスを展開させる大型プロジェクト『HiGH＆LOW』の劇場版第2弾。SWORD地区でチーム“ムゲン“と並び最強と称された“雨宮兄弟“を中心に物語が展開し、突如姿を消した長男の行方と、隠されていた兄弟の秘密が明かされていく。シリーズ初登場となる3兄弟の長男・雨宮尊龍を斎藤工が演じる。雨宮3兄弟は両親を亡くして以来、支え合って生きてきた。しかし1年前に突如、長男の尊龍が姿を消してしまい、残された弟の雅貴、広斗は兄を探し続けていた。そんな時、両親の命日に参拝に訪れた雅貴と広斗の前に、尊龍の行方の手がかりを知る人物が現れる。

タイトル「1%er」は武道、武術のみならずさまざまな技や道を極めたわずか1%の存在を表している。