忍者は、存在しない。…と、我々は思っている。仮に忍者が存在したところで、忍者はその姿を我々に晒すことはない。だからこそ、忍者は『表向きには』存在しないのだ。主人公、樱羽一时は、我々と同じく忍者は存在しないと思っている、普通の男子。彼には普通の、幸せで辉かしい日々が约束されている…はずだった。ある日、一时は命を狙われ、それが甲贺忍者の仕业であると闻かされる。なぜ一时は命を狙われたのか？それは…彼が由绪正しき、伊贺忍者第１９代正当後継者だったからなのだ！伊贺と甲贺は长年対立しており、甲贺は伊贺を侵略しようとしている。一时が生きるためには…自らも忍者になるしかない！こうして、谁も知らない忍者の世界に身を投じる一时。一人前の忍者となるべく学び、戦い、苦难に立ち向かう。だがそれは、一时が辿る过酷な运命の、ほんの序章でしかなかった…。

经过重重磨难，健四郎和尤莉亚终于迎来相聚的一刻，但是他们的时间所剩无几，在尤莉亚的请求下，健四郎开始讲述这些年来的故事：作为最强杀人拳——北斗之拳的唯一继承人，健四郎和爱人尤莉亚正准备展开新的生活。然而适值乱世，愚蠢的统治者亲手毁灭了原本的文明，活下来的人为了生存而选择暴力，杀戮成为当下的唯一准则。健四郎和尤莉亚遭遇南斗水鸟拳的阿殉，为了得到心爱的女人，阿殉不择手段，更在健四郎的胸口留下七个伤疤。痛失爱人，健四郎迎来生命的第一重磨难……